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Base de données bioinformatiques


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Le système global de recherches inter-bases de données Entrez (en anglais Entrez Global Query Cross-Database Search System) permet d'accéder à des bases de données du site internet du National Center for Biotechnology Information (NCBI). Le NCBI fait partie de la National Library of Medicine (NLM), qui est elle-même un département des National Institutes of Health (NIH) du gouvernement des États-Unis.




Sommaire





  • 1 Recherches


  • 2 Bases de données


  • 3 Genbank


  • 4 Catalogue NLM


  • 5 Voir aussi

    • 5.1 Article connexe


    • 5.2 Lien externe





Recherches |




Bases de données |


Entrez permet de faire une recherche globale ou filtrée dans les bases de données suivantes :



  • All Databases : recherche dans toutes les bases de donnée ci-dessous


  • NCBI web site : NCBI web and FTP web sites


  • PubMed : littérature scientifique et biomédicale avec le plus souvent accès aux résumés (en anglais : abstracts). La consultation de l'article intégral est également possible pour certains journaux lorsqu'un lien a été établi avec l'éditeur.


  • Protein : recherche de séquences de protéines


  • Nucleotide : recherche de séquences de nucléotides (GenBank)


  • EST : Expressed Sequence Tags Database


  • GSS : Genome Survey Sequences Database


  • Structure : structures macromoléculaires en 3D


  • Genome : séquences complètes de génomes Mapping


  • BioSystems : voies métaboliques et systèmes biologiques


  • Books : livres en ligne


  • CancerChromosomes : aberrations cytogénétiques des cancers


  • Conserved domains : domaines conservés des protéines


  • 3D Domains : domaines de protéines en 3D


  • Epigenomics : modifications qui contrôlent l'expression des gènes


  • Gene : information complète sur les gènes


  • Genome Project : informations issues du Human Genome Project


  • dbGAP : génotypes et phénotypes (database of Genotypes and Phenotypes)


  • dbVar : variations structurelles de l'ADN (inversions, translocations, insertions et délétions)


  • GENSAT : atlas d'expression de gènes du système nerveux central de la souris


  • GEO Profiles : profils d'expression de gènes


  • HomoloGene : séquences homologues chez des groupes eucaryotes


  • Images : images, figures et tableaux provenant des articles déposés dans PubMed Central


  • MeSH : Catalogue des descripteurs (Medical Subject Headings)


  • NLM Catalog : données bibliographiques de la bibliothèque Nationale de Médecine américaine (NLM)


  • OMIM : transmission mendelienne chez l'homme


  • OMIA : transmission mendelienne chez l'animal


  • Peptidome : données d'identification de peptides et de protéines par spectrographie de masse en tandem


  • PMC : Pubmed Central, sous-ensemble de PubMed comportant l'intégralité des articles accessibles librement


  • PopSet : données sur l'étude des populations (épidémiologie)


  • Probe : séquences spécifiques pour sondes moléculaires


  • Protein cluster :


  • PubChem BioAssay : bio-activité des substances chimiques


  • PubChem Compound : activité biologique et structure chimique de composés uniques


  • PubChem Substance : activité biologique et structure chimique de composés complexes


  • SNP : polymorphismes nucléotidiques simples


  • SRA : données issues du séquençage de dernière génération [Short Read Archive (SRA)]


  • Taxonomy : organismes dans GenBank Taxonomie


  • UniGene : groupe de séquences transcrites issues d'un même gène


  • UniSTS : séquences uniques de l'ADN dont la localisation est la position sont connues


Genbank |


Article détaillé : GenBank.



Catalogue NLM |




Voir aussi |



Article connexe |


  • Ressources en chimie


Lien externe |


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